2018年10月31日，马里兰年夜学Alex MacKerell传授应高加力传授约请到访我院，于D栋阶梯教室做了题为“Can CADD Drive GPCR Drug Design? Rapid Estimation of Relative Binding Affinities Based on Pre-computed Ensembles”的陈诉。

起首，Alex MacKerell传授先容了计较机辅助药物设计的基本常识。快速、正确地预计配体相对于的亲及性为计较要领引导药物设计及开发提供了潜力，是以，Alex MacKerell传授课题组开发了两种基在估计算系综的要领：配体竞争饱及位点辨认法（SILCS）及单步自由能微扰法（SSFEP）。SILCS要领基在利用振荡μex宏不雅正则蒙特卡罗/份子动力学(GCMC/MD)模仿卵白质的计较官能团亲及力画图(FragMaps)，该模仿思量了卵白质去溶剂化、官能团去溶剂化、卵白质的柔性以和卵白质间彼此作用的孝敬。于SSFEP要领中，对于先导物-卵白质的复合物举行MD模仿，从中得到配体-卵白质构象的系综。于溶液中对于配体举行了近似的计较。然后，可以于单步微扰的环境下利用自由能微扰公式来评估与先导合物小的化学润色相干的自由能差异。

其次，Alex MacKerell传授先容了以上两种要领于GPCR药物设计中的运用。SILCS要领可运用在一系列年夜份子，包括那些具备很深的或者者不成靠近的联合口袋的年夜份子，如GPCR及核受体卵白。从GCMC/MD模仿获得的网格自由能(GFE)图谱可以定性及定量地用在引导配体设计。SSFEP要领均也可用在GPCR先导化合物的鉴定与优化。Alex MacKerell传授对于两种要领于GPCR药物设计中的运用举行了具体解说。

讲座竣事后，同窗们积极发问。Alex MacKerell传授当真具体地对于同窗们的问题举行了解说，博得了阵阵掌声。（文字/陆正昌）

佳宾简介：

Alexander MacKerell传授

马里兰年夜学，药学院，药学系Grollman-Glick传授

马里兰年夜学，药学院，计较机辅助药物设计中央主任