三木SEO-吴云东课题组在环状多肽的结构预测上取得重要进展

时间:2025-10-25 13:29:57

北京年夜学深圳研究生院吴云东院士课题组近来于 J. Phys. Chem. Lett.(物理化学通信)上发表了最新结果:利用残基特异性力场举行环状多肽的正确布局猜测和构象阐发。J. Phys. Chem. Lett. 是物理化学范畴影响因子最高的杂志,Nature Index收录的68个高影响力杂志之一,影响因子为7.46。 多肽类药物介在小份子及卵白质之间,同时具备二者的一些上风,最近几年来愈来愈受广泛存眷。与线性肽比拟,环状多肽有构象相对于刚性、 代谢不变性好、易穿过生物膜等怪异的上风。而且,许多自然活性物资都是环状多肽。环状多肽的活性依靠在其三维布局,假如能经由过程序列正确地(靠近试验精度)猜测其布局,可以年夜年夜地帮忙人们于此邻域的研究。 该事情利用吴云东课题组成长的RSFF2力场,可以正确地猜测出20个环肽中的17个,与晶体布局的均方误差(RMSD)小在1.1Å。新要领的正确度较着高在以前的要领。别的,还有发明相对于在线性多肽,环状多肽的构象取样与球卵白更相似,为环状多肽于药物设计中作为卵白份子的替换物提供了理论上的撑持。

该事情第一作者为化学生物学与生物技能学院博士研究生耿浩,蒋帆博士为配合通信作者。(Geng, H.; Jiang, F.; Wu, Y.-D. Accurate Structure Prediction and Conformational Analysis of Cyclic Peptides with Residue-Specific Force Fields. J. Phys. Chem. Lett. 2016, 7, 1805–1810 DOI: 10.1021/acs.jpcle三木SEO-tt.6b00452)。 文章链接pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jpclett.6b00452

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